微生物来自哪里？一定不是出生的时候微生物就存在的，微生物不是人体产生的，是来自于环境。把男性女性和不同年龄段的孩子身体各个部委的菌群做一个分析，在婴幼儿的阶段它的菌群是母亲的阴道，粉色的是婴儿的菌群，他的口腔皮肤肠道的菌群是母亲的阴道。随着年龄的增长他的菌群就远离阴道，接近成年人的口腔，一开始来自于母亲，然后生活中环境的影响对他的菌群影响最大。2015年的时候就做了更详细的研究，把三类母亲，他的菌群测一下，对他们生育的孩子在出生的第4天，第4个月做一个差异，孩子和母亲的菌群是一样的，不同母亲所生的孩子差异最大。还有母乳喂养，和非母乳喂养，和剖腹产和顺产是不一样的。肠道菌群第一是来自母亲。第二个是来自食物。对肠道菌群影响最大的是母乳喂养，断奶是影响肠道菌群组成的一个节点，换辅食的对肠道菌群是非常有挑战性的节点。
最新的研究对刚才的来源又往前提前了，这是中科院做的。新生儿最初的来源不是出生后，而是子宫中，空腔内就开始了，在空腔里头，在刚出生的时候，其实婴儿的口腔，肠道，嘴巴还有皮肤上都已经有了微生物，微生物的种类和数量比母亲的产道的微生物种类和数量还丰富，随着出生微生物的种类和数量是降低的。母亲对微生物的传递是垂直传递的，母亲传给孩子的，母亲不健康，孩子的微生物也不健康。妊娠糖尿病妇女生的孩子菌群跟正常人也不一样，母亲菌群的健康也决定孩子菌群的健康。
除了人的产道之外，人的乳汁中也有几百种微生物，现在所有的研究里面没有考虑母乳的微生物的组成，而且无论这些奶粉企业如何去改进母乳，让他最大限度的接近天然的母乳，他仍然无法把微生物添加进去，还是母乳喂养好，只有20%多的坚持母乳喂养，这个比例太低了，大家应该更多的去鼓励这些孩子的妈妈去尽最大的可能母乳喂养，因为所有的奶粉都没有办法取代母乳。
胎儿菌群的来源是哪呢？主要来源于循环系统，母亲的血液循环系统它的来源是阴道，口腔的肠道，这三个部位的菌通过血液系统到胎盘，影响孩子的菌群。阴道除了在生产中，还对婴幼儿的菌群进行接种，剖腹产和顺产影响的方式，顺产过程中母亲阴道中的菌到进行接种，导致母亲的菌在他的体内生长繁殖。胎儿的菌，导致他的健康状况和成年之后的健康状况。母亲影响胎儿菌群在空腔中，还有生产的过程中是剖腹产还是顺产，还有哺乳的过程。
